Minecraft:MojangアカウントからMicrosoftアカウント以降した時に起動構成が消える

たぶんパスが消えてるだけ。

起動構成の New Installation からディレクトリを参照して.minecraft とか mod ように作った起動構成のあるフォルダを指定すれば戻ってくる。

ただ、バージョンを覚えてないとちょっとめんどうかもしれない。

.minecraft のある場所

自分のユーザー名のフォルダ/AppData/Roaming/.minecraft

とか

AppData フォルダは隠しフォルダになるので表示するように設定する必要がある。